Kościół ten powstał na początku XIV w. Zbudowano go w pobliżu kościoła w. Krzyża. Był kościołem szpitalnym, prowadzonym przez duchaków. Pierwotna budowla spłonęła w 1528 r., zespół szpitalny jednak wkrótce odbudowano. Kościółek był niewielki, murowany, połączony z salą szpitalną tak, aby chorzy mogli uczestniczyć w nabożeństwach. W 1783 r. przekazano kościół księżom emerytom, którzy jednak nie przetrwali tutaj długo - tylko do 1807 r. Po tej dacie kościół został przebudowany na cele mieszkalne. Szpital, w zarządzie miejskim, funkcjonował jeszcze do lat siedemdziesiątych XIX w. Budynek kościoła wraz z zabudowaniami szpitalnymi zburzono w 1892 r. w atmosferze skandalu. Przeciwko wyburzeniom zabytkowych budynków w celu uzyskania miejsca pod budowę nowego teatru miejskiego (dzisiejszego Teatru im. Słowackiego) protestował m.in. Jana Matejko. Bezskutecznie.